学校创办于1992年9月，原名为“北海市第九小学”。1996年8月被评定为“北海市一级学校”；1999年1月通过了自治区“两基”达标验收，成为广西首批、北海唯一的一所“两基”达标合格学校；2001年12月通过了国家“两基”复查验收，再次确认为“两基”达标合格学校。
2002年7月更名为“北海市海城区第九小学”。2004年5月经自治区人民政府同意增挂“北海市少儿艺术学校”牌子。2006年3月由北海市教育局移交给海城区管理。2007年4月被评为“全国红旗大队”。2008年10月晋升为自治区示范性普通高级中学。